After the Dawn Rebellion, Char travels to Earth and meets a girl with mysterious powers named Lalah Sune.　　Meanwhile, Amuro's father Tem Ray is working on the RX-78 development project. Learning of the defection of Doctor Minovsky, a key figure in Zeon mobile suit development, he heads for the moon. History's first battle between mobile suits unfolds in the twilight zone of the lunar surface.　　Then comes Universal Century 0079. Side 3, the space city furthest from the Earth, launches a war of independence against the Earth Federation government under the name of the Principality of Zeon.　　An era of violent upheaval begins, in which half of the total human population will be killed...

　　宇宙世纪0068年，居住在SIDE3的慕佐自治共和国议长发表完《完全独立宣言》后意外身亡，由此引发了连番的动乱，许多人的命运也就此发生根本转变。转眼来到宇宙世纪0074年，爱德华·玛斯（池田秀一 配音）以夏亚·阿兹纳布的身份进入吉恩自治共和国国防军官学校学习。在那里，他与来自SIDE3的名门子弟格尔玛（柿原彻也 饰）互相赏识，成为模拟好友。　　宇宙世纪0077年，学生们揭竿而起，发起了针对地球联邦军的武装起义。对夏亚来说，他的复仇也由此拉开序幕……

　　宇宙世紀0071年。サイド3ムンゾ自治共和国の議長だった父ジオン・ズム・ダイクンを亡くしたキャスバルとアルテイシアは、父の側近ジンバ・ラルと一緒にサイド3を脱出。地球で、エドワウ・マスとセイラ・マスと名前を変えて生活していた。一方サイド3はジオン自治共和国と国名を改め、副議長だったデギン・ソド・ザビ率いるザビ家が実権を掌握。ザビ家はキャスバルとアルテイシアを追いつつ、対地球連邦軍をにらみ、新兵器のモビルワーカーの開発に着手していた。

漫画第5卷(2011年3月22日发售)附带高级动画DVD的限定版同捆，收录了《世界第一初恋~小野寺律的情况~》的第0话(约20分钟)。工作人员和tv动画版差不多。漫画第6卷(2011年9月27日发售)附带高级动画DVD的限定版同捆。标题是“世界第一初恋~羽鸟芳雪的情况~”，tv动画版是12.5话(收录约20分钟)。原型是“羽鸟芳雪的情况No.1”。